Con una inversión de 150 millones de pesos, el museo tendrá una superficie de construcción de casi 9,500 m2 con una capacidad de hasta 5 mil visitantes diarios. Contará con seis niveles como son: sótano, planta baja, mezzanine, primer nivel, segundo nivel y azoteas y una plaza pública. Además, el diseño es sustentable pues permite una buena entrada de luz y ventilación natural. Pero también incluirá luces LED, muros permeables, azoteas verdes y jardines con sistema de captación de agua pluvial y más de 500 árboles en la propiedad, contará también con accesos universales.
Vale anotar que en la planta baja se localiza el programa público, cafetería, tienda, etc, y a partir del mezzanine inicia el recorrido interactivo por las áreas de exposición en las plantas superiores. En el mezzanine, además, están las salas multiusos y el vestíbulo de acceso al teatro IMAX. En los distintos niveles se ubican zonas programáticas, tocas con un espacio exterior que puede ser terraza o huerto.