Cerca a Pénjamo se encuentra además uno de los sitios arqueológicos más grandes del estado, es la Zona Arqueológica de Peralta, la cual cuenta con construcciones importantes como el doble templo, el patio hundido y el recinto de los gobernantes, entre otros. Es uno de los centros cívicos ceremoniales más importantes del centro-norte de Mesoamérica.
Pero también, a pocos kilómetros puede visitar la Zona Arqueológica de Plazuelas, uno de los asentamientos más complejos de la región, pues está conformado por siete edificios asentados en 3 laderas que se comunican entre si a través de largas calzadas y veredas. En este lugar es importante observar los símbolos tallados en las rocas que aluden a la concepción del universo. Especialmente por estos lugares vale la pena conocer Pénjamo, pero sin duda el visitante puede disfrutar de muchos más sitios interesantes.